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Repenser la biologie à partir de paramètres fondamentaux trop souvent négligés
mercredi 24 avril 2024

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Descriptif

« Repenser la biologie à partir de paramètres fondamentaux trop souvent négligés »

Par Jacques Fantini, professeur de biologie, Université d’Aix-Marseille, UNIS UMR_S 1072

Exposé donné dans le cadre du Séminaire Cavaillès (Histoire et Philosophie du vivant) organisé par la République des Savoirs.

Définir la vie est une tâche ardue qui suscite bien des débats chez les philosophes et les scientifiques depuis des siècles. Or la biologie souffre d’un manque de définition claire, plaçant les biologistes dans la situation paradoxale où l’on peut décrire au niveau atomique des objets complexes qui restent globalement mal définis. On pourrait supposer que de telles descriptions permettent de caractériser parfaitement les systèmes vivants. Cependant, de nombreux cas d’interprétation erronée relativisent cette hypothèse. Dans cet exposé, je mettrai l’accent sur des paramètres fondamentaux qui sont minimisés voire totalement ignorés dans les ouvrages de biologie destinés aux étudiants : l’eau, l’entropie, les dimensions spatiale et temporelle, les propriétés quantiques et le potentiel électrostatique. D’où vient la structure hélicoïdale de l’ADN, pourquoi la reproduction des organismes vivants ne peut se faire sans mutations, quelles sont les limites du code génétique, pourquoi toutes les protéines n’ont pas une structure tridimensionnelle stable : autant de questions qui ne peuvent être résolues sans
tenir compte des paramètres mentionnés ci-dessus. En effet, sans prétendre à l’exhaustivité : i) le temps et l’espace contraignent de nombreux mécanismes biologiques qui nécessitent des solutions efficaces propres aux systèmes vivants (enzymes, transporteurs), ii) l’eau contrôle la fidélité de la réplication de l’ADN et l’équilibre structure/désordre des protéines, iii) l’entropie intervient fréquemment dans les interactions moléculaires et dans de nombreuses réactions enzymatiques, iv) les mécanismes quantiques expliquent pourquoi une molécule aussi simple que l’acide cyanhydrique (HCN) préfigure la double hélice de l’ADN, pourquoi des mutations se produisent, et comment le champ magnétique terrestre peut déterminer la migration des oiseaux (boussole quantique), v) le potentiel de surface contrôle les mécanismes épigénétiques, l’analogie ADN/membrane et les interactions agent pathogène-hôte. La prise en compte de ces paramètres fondamentaux est essentielle pour mieux comprendre ce qu’est la vie et comment elle gère l’ordre et le chaos à travers une combinaison de mécanismes génétiques et épigénétiques.
Articles :

What is life ? Rethinking biology in light of fundamental parameters en ligne sur le site de Life.
Fundamental Mechanisms in Membrane Receptology: Old Paradigms, New Concepts and Perspectives

Le séminaire Cavaillès: perpétuant les orientations impulsées par Jean-Jacques Kupiec lors de sa création, le séminaire Cavaillès se donne pour objet l’histoire et la philosophie des sciences du vivant. Une fois par mois un acteur des sciences expérimentales ou humaines est invité à y présenter ses travaux et réflexions.

 

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Auteur(s)
Jacques Fantini
Université d’Aix-Marseille
Professeur de biologie

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Cursus :

Jacques Fantini est professeur de biologie, Université d’Aix-Marseille, UNIS UMR_S 1072.

Professeur des Universités (classe exceptionnelle), membre de l’Institut Universitaire de France, Jacques Fantini est l’auteur de plus de 200 publications scientifiques (dont 4 PNAS communiqués par deux Prix Nobel et deux Prix Lasker).

Spécialiste mondialement reconnu de la modélisation moléculaire, il a élaboré de nouveaux concepts d’intelligence artificielle appliquée aux systèmes membranaires dans le contexte des neurosciences moléculaires et de l’infectiologie. Il est le co-inventeur de la molécule brevetée AmyP53 dont il détient, avec le Pr. Nouara Yahi, la propriété intellectuelle.

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Dernière mise à jour : 28/06/2024